L’Area Marina protetta è beneficiario associato del progetto MedSeaLitter, finanziato nell’ambito del programma INTERREG MED 2014/2020 e avente come capofila ISPRA.
Il progetto MEDSEALITTER, avviato nel 2017, mira a creare una rete tra aree marine protette, organizzazioni scientifiche e organizzazioni non governative per sviluppare, testare e applicare protocolli efficaci, per monitorare e gestire l'impatto dei rifiuti plastici sulla biodiversità.
Il progetto prevede monitoraggi di macro e micro marine litter.
Una delle attività principali, nella quale è coinvolta l’AMP Isole Egadi insieme all’AMP di Capo Carbonara è il monitoraggio della marine litter lungo le rotte dei traghetti che collegano la Sicilia alla Sardegna al fine di conoscere e quantificare il problema dei rifiuti in mare, nonché gli effetti su ambiente e organismi.